Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc2P20801 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms