Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfaP20033 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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PdgfaP20033 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfaP20033 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms