Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NefhP19246 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NefhP19246 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NefhP19246 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NefhP19246 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NefhP19246 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NefhP19246 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NefhP19246 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NefhP19246 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NefhP19246 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms