Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnnc1P19123 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms