Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtpraP18052 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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