Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PcnaP17918 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PcnaP17918 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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