Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms