Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RhoP15409 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RhoP15409 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RhoP15409 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RhoP15409 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RhoP15409 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms