Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd44P15379 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd44P15379 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms