Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Irf1P15314 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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