Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt1P13864 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt1P13864 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms