Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms