Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms