Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms