Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P10404 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P10404 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P10404 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms