Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CatspereP0DP43 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms