Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms