Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-Eb1P04230 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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