Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01741 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01741 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01741 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01741 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms