Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01673 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01673 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01673 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01673 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms