Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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P01659 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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P01659 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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P01659 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01659 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01659 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01659 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01659 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01659 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01659 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P01659 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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P01659 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01659 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms