Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01648 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01648 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01648 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01648 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01648 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01648 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms