Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl20O89093 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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