Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc6O88978 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms