Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnal1O88327 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms