Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sorl1O88307 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms