Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms