Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lnx1O70263 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms