Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl35aO55142 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms