Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SlkO54988 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SlkO54988 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SlkO54988 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SlkO54988 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms