Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChkaO54804 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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