Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffaO54786 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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DffaO54786 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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DffaO54786 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffaO54786 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffaO54786 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffaO54786 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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