Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limk2O54785 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limk2O54785 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limk2O54785 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Limk2O54785 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms