Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc4O35988 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Sdc4O35988 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms