Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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FxnO35943 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FxnO35943 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FxnO35943 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FxnO35943 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FxnO35943 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FxnO35943 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FxnO35943 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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