Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pik3cdO35904 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pik3cdO35904 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms