Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms