Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lhx8O35652 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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