Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edil3O35474 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms