Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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