Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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ColqO35348 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ColqO35348 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ColqO35348 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ColqO35348 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ColqO35348 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ColqO35348 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ColqO35348 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms