Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf11aO35305 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf11aO35305 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms