Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms