Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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