Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp35M0QWN7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms