Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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