Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm2035J3QP87 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms