Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mfsd4b4J3QNS5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms