Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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