Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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